%0 Journal Article %A Abidi, Mohadese %A Soheilifard, Reza %A Hasanzadeh Ghasemi, Reza %T The effect of temperature on the binding affinity of Remdesivir and RdRp enzyme of SARS-COV-2 virus using steered molecular dynamics simulation %J Journal of Control %V 14 %N 5 %U http://joc.kntu.ac.ir/article-1-815-fa.html %R 10.52547/joc.14.5.39 %D 2021 %K SARS-COV-2, RNA-dependent RNA polymerase, Molecular Docking, Steered Molecular Dynamics Simulation, Remdesivir, %X ویروس مرگ بار سارس-کووید-2 اولین بار اواخر سال 2019، در چین پدیدار شده ‌‌است. این ویروس توالی مشابهی با ویروس سارس- کووید در سال 2002 داشته، با این تفاوت که سرعت انتقال آن بسیار زیاد می‌‌باشد. از طرفی سارس- کووید-2، یک RNA ویروس بوده و برای رونویسی ژنوم ویروسی خود نیازمند آنزیم RdRp است. به سبب در دسترس بودن محل فعال این آنزیم، هدف قرار دادن آن برای مهار تکثیر سارس- کووید-2 یک روش درمانی موثر محسوب میشود. رمدسیویر یک مهارکننده‌ی ویروس هپاتیت C و ابولا و مورد تایید سازمان غذا و دارو، نتایج مثبتی را در مهار پروتئاز اصلی و RdRp سارس-کووید-2 نشان داده است. هدف از بررسی حاضر مشاهده عملکرد رمدسیویر برای مهار RdRp در دماهای متفاوت با روش شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هدایت شده، می‌باشد. بدین منظور رمدسیویر و RdRp پس از اتصال با داکینگ مولکولی در چهار دمای متفاوت (از17 تا 47 درجه سانتی‌گراد) مورد ارزیابی قرار گرفتند. با توجه به نتایج بدست آمده، نیروی گسیختگی و کار کشیدگی برای جدا شدن رمدسیویر از RdRp، با افزایش دما، کاهش می یابند. همچنین در دماهای بالاتر، انرژی آزاد گیبس به سبب ارتباط با کار کشیدگی کاهش می‌یابد. %> http://joc.kntu.ac.ir/article-1-815-fa.pdf %P 39-47 %& 39 %! %9 Research paper %L A-10-1288-1 %+ Hakim Sabzevari University %G eng %@ 2008-8345 %[ 2021